Investigadores del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), en colaboración con la Fundación “Jiménez Díaz”, descubrieron que pacientes vacunados e infectados con la variante alfa durante la tercera ola de la pandemia de Covid-19 (entre enero y marzo de 2021), ya presentaban mutaciones con las características de las variantes delta plus, iota y ómicron.
Este estudio interdisciplinario, publicado en la revista ‘Journal of Clinical Investigation’, analizó en detalle por primera vez en España muestras de hisopos nasofaríngeos correspondientes a pacientes vacunados y posteriormente infectados durante la tercera ola de la pandemia.
El trabajo se realizó previo a una metodología de secuenciación ultra profunda, que permite detectar secuencias víricas mutadas que se hallan en proporciones muy bajas, que no son detectables por las técnicas de secuenciación habituales de poca profundidad. En la tercera ola del Covid-19 ya había pacientes infectados con la variante ómicron.
«De cada muestra analizada y de cada trozo del virus analizado obtenemos muchas miles de secuencias. Eso nos permite detectar mutaciones a distintos niveles de frecuencia coexistiendo dentro del paciente infectado», explicó la investigadora del Centro Nacional de Biotecnología (CNB-CSIC) y del Instituto de Investigación Sanitaria de la Fundación “Jiménez Díaz”, Celia Perales.
Los resultados revelaron que a pesar de que los pacientes se infectaron con la variante alfa, en la tercera ola de Covid-19 ya existían pacientes infectados con la variante ómicron predominante en esa fecha (entre enero y marzo de 2021). Hubo cambios correspondientes a las variantes delta plus, iota y ómicron, porque ya estaban presentes en esas muestras meses antes de que adquiriesen relevancia epidemiológica.
«Este trabajo resalta la necesidad de analizar las poblaciones de virus con alta resolución y en profundidad para obtener una visión conjunta de los muchos mutantes que coexisten en cada individuo infectado», dijo el investigador del Centro de Biología molecular Severo Ochoa (CBMSO-CSICUAM), Esteban Domingo.
Estos análisis podrían permitir el seguimiento de mutaciones o conjunto de mutaciones relevantes con anterioridad a que puedan formar parte de variantes peligros
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